苗塞的顏色會影響植物根部的溫度。白色發泡膠盤反射性好，多用于夏秋季的早期育苗，以反射光線，減少幼苗根部的熱量積累。冬春季節選擇黑色秧盤，因其吸光性好，有利于秧苗根系的綠色化。幼苗長大后，要開始使用控根快速育苗技術，移入控根快速育苗容器繼續生長。
育苗，由于幼苗抗逆性增強，種植不損傷根系，如果幼苗裸根往往會影響成活率，而穴盤育苗屬于帶塊移栽，所以大田種植后，幼苗延遲快，成活率高。
穴盤育苗采用精量播種，一次成苗，自動控制混基質、裝盤、播種、覆蓋等一系列操作。苗齡比常規育苗縮短10-20天，勞動效率提高5-7倍。常規育苗人均管理2.5萬株，穴盤育苗15萬株。由于機械化作業管理程度高，降低了工作強度和工作量。常規育苗每塊土平均重0.5-0.75公斤，每公頃蔬菜(平均6萬株)相當于移土30-45噸，而穴盤育苗采用輕型基質，種植時每株苗僅重35-50克。
播種在穴盤里，讓幼苗在穴盤里生長，長大后再移入苗盆，或開溝分苗，或大田種植；播種于秧盤，將秧苗移入穴盤，長大后移入秧碗，或開溝分秧，或種植；這種方式一開始占地少，特別適合早春氣溫低的時候育苗，等外界氣溫升高后再轉移到其他保護區育苗，可以降低取暖成本。如果沒有種植較大的幼苗，可以直接用穴盤苗培育。
穴盤育苗是干種直播，一穴一種，集中育苗。萬株苗耗煤量是常規苗的25% ~ 50%，節約能源2/3。單位面積苗數高于常規苗。按每盤穴數，每公頃可育苗315萬~ 1080萬株。使用穴盤育苗可以有效增加保護地的生產面積。
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