微孔濾膜和一次性微生物限度過濾器與過濾頭連接，保證微孔濾膜完好。將事先配制好的試液注入濾杯中，不要校準濾杯。按“電源”鍵，然后打開相應的閥門，再按“電源”鍵，完成細菌收集和過濾。所有測試溶液過濾后，關閉相應的閥門，然后按“電源”鍵，完成細菌收集和過濾。
在抽濾之前，應確保管道具有良好的密封性能。在打開無菌包裝前，使用一次性微生物限度過濾器檢查包裝是否損壞。加入試液時，液體高度不應超過濾杯的刻度。微生物限度儀要時刻注意吸瓶的情況，液體不能吞沒進氣口。吸濾瓶的容積可根據實際情況選擇。如果無菌室用化學藥品消毒，請將儀器放在密封的蓋子中或移出無菌室，以避免損壞電子部件和腐蝕金屬部件。環境溫度控制在10℃ ~ 30℃。相對濕度≤80%RH無水滴凝結。每次使用后，應該用酒精擦洗儀器的外表。
維護操作步驟:取下過濾器，按住取膜設備，用無菌鑷子取下微孔膜。微孔濾膜的微生物面朝上，附著在配制好的培養基上。微孔濾膜上不能有氣泡(氣泡會影響微生物的生長)。將培養皿轉移到一個罐中，在常規溫度下培養。微生物限度儀運行后，切斷電源。
主機的外表用酒精擦洗干凈。有必要通過有效接地來保護和維護儀器。濾膜的原材料要根據樣品的性質來選擇，過濾前后要保證濾膜的完整性。儀器不工作時，請斷開電源。當儀器處于待機狀態時，關閉電磁閥并將其設置為“關”。不能過濾強酸？強堿？強氧化劑？強腐蝕性液體。當測試樣品含有不溶性微粒和懸浮物時，可能會導致濾膜堵塞，影響過濾。應對測試溶液進行預處理，以去除顆?；驊腋∥?。