分子蒸餾技術是一種特殊的液-液分離技術，產生于20世紀20年代。它是隨著真空中氣體運動理論的深入研究和真空蒸餾技術的不斷發展而逐漸興起的一種新型分離技術。目前，分子蒸餾技術已經成為分離技術的一個重要分支。分子蒸餾器又稱短程蒸餾器，是在高真空(殘余氣體分子壓力為0.1Pa)下進行連續蒸餾過程的儀器。分子蒸餾過程不同于傳統的蒸餾過程。傳統的蒸餾是在沸騰溫度下分離，蒸發和冷凝過程是可逆的，液相和氣相會形成平衡狀態。分子蒸餾是不可逆的蒸餾過程， 該反應在遠離大氣壓下物質沸點的溫度下進行。更準確的說，是一個分子蒸發的過程。
(1)分子運動的平均自由程。任何分子的自由程都是在運動過程中不斷變化的，短程分子蒸餾儀在一定時間內的平均自由程就是平均自由程。設Vm為分子的平均速度，f為碰撞頻率，λm為平均自由程。那么λm=Vm/f，所以f = VM/λ m。
(2)分離因子Langmuir研究了高真空下純物質的蒸發現象，從理論上推導出純物質的分子蒸發速率比普通蒸餾高1/2倍，因此可以用分子蒸餾技術分離揮發性相近但分子量不同的混合物。
(3)分子蒸餾技術的基本原理。根據分子運動的平均自由程公式，不同種類的分子由于有效直徑不同，平均自由程也不同，也就是說是不同種類的分子。