稱取0.2g-1.0g樣品，置于消解罐中，加入2mI水和適量酸。通常是硝酸、鹽酸、氫氟酸、雙氧水等。將罐蓋上并放入爐中。當微波穿過樣品時，分子取向隨微波頻率快速變化。在2450MHz的微波下，分子以每秒2.45×109次的速度改變方向，分子來回旋轉，與周圍的分子發生碰撞和摩擦，分子的總能量增加，使樣品溫度急劇上升。同時，帶電粒子(離子、水合離子等。)在電場力的作用下來回移動，同時也與相鄰分子發生碰撞，使樣品溫度升高。這種加熱方式完全不同于傳統的電爐加熱方式。
(1)身體加熱。電爐加熱時，能量通過熱輻射、對流和熱傳導傳遞，熱量通過爐壁由外向內傳遞給樣品，樣品通過熱傳導加熱。微波加熱法是一種直接的整體加熱法，微波可以穿透到試液內部。
在樣品的不同深度，微波同時產生熱效應，不僅加熱更快，而且更均勻。加熱時間大大縮短，比傳統加熱方式更快更高效。比如在微波(2450MHz，800W)的作用下，可以在1分鐘內將氧化物或硫化物加熱到幾百攝氏度。再比如1.5g的Mn02用650W的微波加熱1min就能加熱到920K，可見升溫速度之快。在傳統的加熱方式(輻射、傳導、對流)中，熱能利用率低，大量熱量輻射到周圍環境，而微波加熱直接作用于材料內部，提高了能量利用率。
(2)過熱。微波加熱也會過熱(即高于沸點溫度)。電爐加熱時，熱量通過墻體由外向內傳導到樣品，墻體表面容易形成氣泡，所以不容易發生過熱，溫度保持在沸點，因為氣化會吸收大量的熱量。在微波領域，“加熱”方式不同，能量直接在系統內部轉換。由于體系中缺少形成氣泡的“核心”，一些低沸點的試劑在密閉容器中容易過熱?？梢钥闯?，密閉溶樣罐中的試劑可以提供較高的溫度，有利于樣品的消化。
(3)攪拌。因為在2450MHz的電磁場中，試劑和樣品的性分子都隨著電磁場的變化而迅速改變取向，分子之間相互碰撞、摩擦，這意味著試劑和樣品的表面不斷更新，樣品的表面不斷接觸新的試劑，加速了試劑和樣品之間的化學反應。交變電磁場相當于一個高速攪拌器，每秒攪拌2.45×109次，提高了化學反應速率，加速了消化。所以微波加熱快速、均勻、過熱，不斷產生新的接觸面。有時，它還能降低反應活化能，改變反應動力學，增強微波消解能力，消解許多傳統方法難以消解的樣品。