另外，液相色譜所用的儀器、設備和操作條件也與氣相色譜不同，所以液相色譜和氣相色譜有一定的區別。
液相色譜是一種分離分析技術，其特點是以液體為流動相，固定相可以有多種形式，如紙、薄板、填充床等。在色譜技術的發展中，為了區分各種方法，根據固定相的形式產生了它們的名稱，如紙色譜、薄層色譜和柱液相色譜。
吸附色譜的固定相是吸附劑，色譜的分離過程是在吸附劑表面進行的，不進入固定相。與氣相色譜不同，流動相(即溶劑)分子也吸附在吸附劑表面。在吸附劑表面，樣品分子與流動相分子競爭吸附，因此流動相的選擇對分離效果影響很大。通常，可以使用梯度洗脫方法來提高色譜分離效率。
離子交換色譜法
離子交換色譜通常使用離子交換樹脂作為固定相。一般來說，樣品離子與固定相離子發生可逆交換，由于各組分離器的交換能力不同而實現色譜分離。