調味品種類很多，儲存過程中暴露在空氣中容易回潮，出現塊狀或不可食用，容易滋生細菌；吃到嘴里的食物要干凈衛生，所以殺菌是一個重要的過程。很多企業在出廠前都會對其進行消毒。
調味品微波殺菌設備的基本原理:
微波意味著頻率在300兆赫到300千兆赫的電磁波。食物中的水和雞蛋白質、脂肪、碳水化合物等分子吸收微波能量后發生碰撞，動能轉化為熱能，使食物發熱，即熱效應；生物體與微波的相互作用也會產生復雜的生物效應，即非熱效應。簡單來說，微波殺菌是微波熱效應和非熱效應共同作用的結果。微波的熱效應主要起到加熱和殺菌的作用；而非熱效應是利用微生物中的蛋白質和生理活性物質發生變異，失去活力或死亡。
微波調味品殺菌設備與其他設備相比的優勢:
1. 殺菌干燥時間短，速度快。
2. 殺菌溫度低，不破壞產品的原有風味；均勻殺菌。
3. 微波滅菌設備易于控制。與常規方法相比，該設備易于使用；無熱慣性，操作方便。。
4. 隧道式微波滅菌設備可連續工作，產量大。
微波殺菌技術的特點；
微波殺菌處理時間短，易于實現機械化連續生產，有利于食品營養。成分和風味影響不大。由于微波的良好穿透性，可用于包裝前或包裝后的產品滅菌。實踐證明，微波包裝在殺菌溫度、殺菌時間、產品質量、產品保質期等方面具有明顯優勢。在調味品、休閑食品、液體飲料中使用微波殺菌，可以減少高溫對產品風味的影響，但調味品等含水量高的包裝食品會進行微波處理。頭發袋子會膨脹和破裂，因此微波處理的參數需要進一步研究。