水平B2B和垂直B2B在以下幾個方面存在區別：
1. 交易對象不同：
垂直B2B是指生產商或商業零售商與上游的供應商之間建立供貨關系，以及生產商與下游的經銷商之間建立銷貨關系。這種模式可以讓更多的生意人習慣于使用搜索模式來建立生意圈，尋找潛在客戶。
水平B2B則是將各個行業中相近的交易過程集中到一個場所，為企業的采購方和供應方提供一個交易的機會。與垂直B2B相比，水平B2B并不一定是擁有產品的企業，也不一定是經營商品的商家，它只提供一個平臺，讓銷售商和采購商在網上匯集，采購商可以在其網上查到銷售商的有關信息和銷售商品的有關信息。
2. 成本差異：
垂直B2B的成本相對較低，因為面對的是某一個行業內的從業者，客戶相對集中且有限。
3. 相同點：
兩者都帶有業務及作業流程自動化處理專業知識。因為一個網站面對的是一個特定的行業、特定的專業領域，所以網站本身應該對這個領域相當熟悉。典型垂直網站的創始人往往對專業技能非常熟悉，通常是采購經理、技術部門負責人或者顧問。他們能夠洞察全行業的內外需求，能一針見血地指出各家“進場人市”企業的需要，并向他們提供靈活有效的各種解決方案。一旦的想法付諸實施，便會吸引很多傳統行業里的年輕人加入進來。
